MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP36

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013263	GCG	2	6	21	26	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013263	GCTG	2	8	75	82	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013263	TGC	2	6	545	550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013263	TAA	2	6	636	641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013263	TTC	2	6	687	692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013263	CAT	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013263	ATA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013263	TCT	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013263	GAC	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013263	TTC	2	6	7052	7057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013263	TTA	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013263	GCCT	2	8	7125	7132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013263	A	6	6	7173	7178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013263	TGA	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013263	T	6	6	7260	7265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013263	TAA	2	6	7307	7312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013263	A	7	7	7336	7342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013263	AG	3	6	7345	7350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013263	CTT	2	6	7379	7384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013263	AAT	2	6	7424	7429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013263	GGA	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013263	G	7	7	7496	7502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013263	CAT	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013263	TAA	2	6	7564	7569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013263	T	8	8	7619	7626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013263	ATTTTT	2	12	7729	7740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013263	T	6	6	7785	7790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013263	TATT	2	8	7846	7853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013263	AGGG	2	8	7938	7945	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013263	GCA	2	6	7999	8004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013263	GGC	2	6	8079	8084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013263	GCG	2	6	8151	8156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013263	GGC	2	6	8161	8166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013263	T	6	6	8221	8226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013263	CTG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013263	ACG	2	6	8344	8349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013263	T	8	8	8363	8370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013263	CAAT	2	8	8382	8389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013263	AGG	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013263	A	6	6	8449	8454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013263	A	8	8	8456	8463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013263	ACT	2	6	8480	8485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013263	GCG	2	6	8524	8529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013263	GC	3	6	8553	8558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013263	TCT	2	6	8583	8588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013263	T	6	6	8595	8600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013263	GA	3	6	10665	10670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013263	TAA	2	6	10700	10705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013263	T	6	6	10724	10729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013263	T	6	6	10745	10750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013263	C	6	6	10767	10772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_013263	CGT	2	6	10776	10781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013263	TGGT	2	8	10841	10848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013263	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013263	CCCAT	2	10	10912	10921	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_013263	A	6	6	11008	11013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013263	GAA	2	6	11560	11565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013263	TAT	2	6	11569	11574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013263	GTT	2	6	11597	11602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013263	TGCT	2	8	11656	11663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013263	TTC	2	6	11692	11697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013263	ATTT	2	8	11703	11710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013263	AT	3	6	11712	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013263	ATT	2	6	11768	11773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013263	TTA	2	6	11831	11836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013263	ACA	2	6	11856	11861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013263	GCA	2	6	11890	11895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013263	TGG	2	6	11898	11903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013263	CGTA	2	8	12609	12616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013263	ACTT	2	8	12657	12664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013263	TACATC	2	12	12708	12719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013263	CAT	2	6	12729	12734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013263	GTC	2	6	12759	12764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013263	AGGGA	2	10	12803	12812	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013263	T	6	6	12902	12907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013263	AGC	2	6	12961	12966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013263	CAA	2	6	12985	12990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013263	AG	3	6	13075	13080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013263	ACG	2	6	16209	16214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013263	TGA	2	6	16218	16223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013263	A	6	6	16237	16242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013263	T	6	6	16265	16270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013263	GAA	2	6	16384	16389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013263	CGC	2	6	17035	17040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013263	ACC	2	6	17079	17084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013263	GGCAT	2	10	17423	17432	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013263	ACG	2	6	17449	17454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013263	ATG	2	6	17533	17538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013263	AGC	2	6	17547	17552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013263	TA	3	6	17594	17599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013263	TGA	2	6	17623	17628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013263	TTC	2	6	18424	18429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013263	TTC	2	6	18494	18499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013263	GCT	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013263	CTT	2	6	18554	18559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013263	TGGCC	2	10	18622	18631	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013263	ATAA	2	8	18660	18667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013263	TAT	2	6	18688	18693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013263	ATTTT	2	10	18695	18704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013263	TAAAA	2	10	18705	18714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013263	GCTT	2	8	18788	18795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013263	AGA	2	6	20428	20433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013263	GGA	2	6	20453	20458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013263	GCATA	2	10	20492	20501	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013263	CCG	2	6	20509	20514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013263	ATC	2	6	20569	20574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013263	CAG	2	6	20583	20588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013263	T	7	7	20610	20616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013263	CAG	2	6	20618	20623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013263	TG	3	6	20659	20664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013263	TTAACG	2	12	20670	20681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013263	C	6	6	20682	20687	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_013263	GGA	2	6	20697	20702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013263	ATT	2	6	22199	22204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013263	AAT	2	6	22216	22221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013263	AGA	2	6	22224	22229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013263	T	8	8	23222	23229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013263	TCC	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013263	GCG	2	6	24258	24263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013263	ATA	2	6	24269	24274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013263	AAT	2	6	24331	24336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013263	AGCAG	2	10	24342	24351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013263	GA	4	8	24442	24449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013263	TGT	2	6	24465	24470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013263	ATC	2	6	24586	24591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013263	CGG	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013263	CGT	2	6	24673	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013263	AT	3	6	24766	24771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013263	AGT	2	6	24772	24777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013263	T	7	7	24830	24836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013263	T	6	6	24840	24845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013263	T	6	6	24939	24944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013263	T	6	6	24955	24960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013263	CTGGTT	2	12	24982	24993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013263	GGC	2	6	25447	25452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013263	A	8	8	25580	25587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013263	T	6	6	25670	25675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013263	TAA	2	6	25731	25736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013263	GA	4	8	25777	25784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013263	A	6	6	25809	25814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013263	ATAA	2	8	25817	25824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013263	A	6	6	25851	25856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013263	CGA	2	6	26489	26494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013263	TGAT	2	8	26529	26536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013263	CTGC	2	8	26540	26547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013263	GTT	2	6	27849	27854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013263	CGCTC	2	10	27926	27935	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_013263	GTG	2	6	28018	28023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013263	TA	3	6	28077	28082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013263	CAA	2	6	28479	28484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013263	GTT	2	6	28498	28503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013263	ACT	2	6	28510	28515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013263	TAC	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013263	GCC	2	6	28568	28573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_013263	AAT	2	6	28584	28589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013263	AG	3	6	28600	28605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013263	ATT	2	6	29713	29718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013263	CA	3	6	29720	29725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013263	GCAA	2	8	29734	29741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013263	A	7	7	29756	29762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013263	CAT	2	6	29763	29768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_013263	CAGC	2	8	29796	29803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_013263	A	7	7	29810	29816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013263	GAG	2	6	29834	29839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013263	CGAT	2	8	29859	29866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_013263	A	6	6	29887	29892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013263	CAT	2	6	29910	29915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_013263	TGA	2	6	29966	29971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013263	CAGGA	2	10	29972	29981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_013263	GTTA	2	8	30018	30025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013263	TTAA	2	8	30028	30035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013263	ATT	2	6	30342	30347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013263	ATG	2	6	30368	30373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013263	TTC	2	6	30385	30390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_013263	TAACT	2	10	30415	30424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_013263	ATG	2	6	30432	30437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013263	TG	3	6	30442	30447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013263	AAGT	2	8	30477	30484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_013263	GAA	2	6	30512	30517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013263	AGA	2	6	30568	30573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013263	AG	3	6	30601	30606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013263	A	7	7	30665	30671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013263	TC	3	6	30691	30696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_013263	TC	3	6	30735	30740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
185	NC_013263	TAAAAG	2	12	30788	30799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013263	CTAAA	2	10	30802	30811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_013263	A	8	8	30809	30816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013263	AACA	2	8	30818	30825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_013263	AGC	2	6	30872	30877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_013263	CGAA	2	8	30887	30894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
191	NC_013263	CCAAG	2	10	30912	30921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_013263	ATCAGT	2	12	31846	31857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
193	NC_013263	ATGA	2	8	31874	31881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_013263	AT	3	6	31885	31890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_013263	TTA	2	6	31892	31897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013263	T	6	6	31908	31913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013263	TTTC	2	8	31929	31936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
198	NC_013263	T	6	6	32041	32046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_013263	TTG	2	6	32069	32074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_013263	T	7	7	33471	33477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_013263	A	8	8	33480	33487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_013263	TCA	2	6	35173	35178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_013263	CAAG	2	8	35253	35260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
223	NC_013263	A	7	7	35585	35591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_013263	CAG	2	6	35692	35697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
225	NC_013263	ACA	2	6	35792	35797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
226	NC_013263	GCC	2	6	35809	35814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.